В 1855 году по приказу царского правительства в местности Хабарнуты была построена церковно-приходская школа, где обучались дети местных богачей. Школа существовала до 1917 года. В это время в Жемчуге была управа. Главой управы был Дармаев Жамнян – самый богатый человек села Жемчуг. Главе подчинялись старосты родов.
В 1889 году Тункинское ведомство разделилось на 3 инородные управы и одно самостоятельное родовое управление. Образовались управы: Харбятская с местоприбыванием в улусе Жемчуг, Койморская и Торская.
В 1920 году после вступления в Тункинский район 5-й красногвардейской армии были воссозданы хошуны. Улус Жемчуг и селения окрест него входили в Харбятский хошун, который возглавлял Сотников Доржо Папатаевич.
В 1920 году улус Жемчуг состоял из 17 населенных пунктов, численностью дворов 660.
В 1922 году образован Баянгольский сомсовет. Он объединял улусы Жемчуг, Бого-Горхон, Охор-Шибирь. Его председателем являлся Шарагулов Лопсон.
В 1932-1934 гг.проходило укрупнение артелей и на месте жемчугских улусов в1932 году был создан колхоз им.Ворошилова.
В декабре 1955 года село Бого –Горхон переименовано в село Жемчуг.
